Американцы удешевили процедуру расшифровки человеческого генома
Американские ученые показали, что затраты на расшифровку человеческого генома уже сегодня можно снизить до $4,4 тысячи. Для сравнения: в 2003 году подобные работы стоили $300 миллионов, потом подешевели до $1 миллиона в 2007 году и до $60 тысяч в прошлом. Специалистам из компании Complete Genomics удалось добиться такого существенного прорыва за счет ускорения процедуры и экономии дорогостоящих химических реагентов, необходимых для расшифровки последовательности нуклеотидов ДНК, пишет газета «Известия».
Обычно при расшифровке длинная двойная спираль молекулы ДНК «нарезается» в короткие одинарные отрезки, которые затем соединяются между собой с помощью синтетических отрезков в кольцевые молекулы, содержащие в себе порядка 400 «букв» ДНК. После этого каждая кольцевая молекула многократно копируется, в результате чего на изначальном кольце наматывается несколько одинаковых кольцевых молекул, образующих шар диаметром примерно 200 нанометров. Эти шары помещаются на пластину с липкими круговыми участками, к которым прикрепляются синтезированные шары фрагментов ДНК. Для считывания последовательности к фрагментам ДНК в шарах прикрепляется искусственный отрезок ДНК длиной в 10 нуклеотидов, снабженный флуоресцентной меткой, светящейся в ультрафиолетовых лучах. После этого с помощью компьютерной программы из миллиардов коротких и частично повторяющихся фрагментов составляется оригинальная последовательность. Авторам публикации удалось добиться упаковки шаров ДНК на пластине со сверхвысокой плотностью, что позволило не только снизить расход реагентов, но и увеличить скорость распознавания флуоресцентных меток.
Благодаря этой методике компания сможет в скором будущем расшифровывать по одному человеческому геному в день, что позволит в будущем активно внедрять генетические исследования в медицинскую практику, особенно в случае сложных и малоизученных заболеваний. В дальнейшем ученые намерены сделать методику еще более точной, с тем чтобы снизить количество ошибок при расшифровке ДНК, которых при существующем подходе в декодированной человеческой ДНК, состоящей примерно из трех миллиардов нуклеотидов, может быть до 30 тысяч, уточняет РИА «Новости».